Program studi S2-Bimbingan dan Konseling di Fakultas Sekolah Pascasarjana Universitas PGRI Madiun merupakan program studi yang menghasilkan lulusan magister bimbingan dan konseling yang professional, cerdas dan berdaya saing yang mampu menguasai teori dan aplikasi bidang bimbingan dan konseling dalam melakukan praktek profesional dan/atau penelitian di bidang bimbingan dan konseling pada seting pendidikan formal dan seting pendidikan non formal, serta mengembangkan karya inovatif melalui pendekatan inter atau multidisipliner. Program studi S2-Bimbingan dan Konseling Universitas PGRI Madiun, secara khusus berupaya mengembangkan kemampuan/jiwa wirausaha yang disebut sebagai counselor-preneur; yaitu kemampuan yang diperlukan untuk mencetak profil sebagai konsultan, pengembang dan entrepreneur di bidang bimbingan dan konseling.